Фамилия Гаипова — женская форма фамилии Гаипов. Её основа восходит к личному имени Гаип (Гаип), которое имеет тюркское происхождение и восходит к арабскому слову «гаиб» (غائب) — «отсутствующий», «скрытый», «невидимый». В исламской традиции это один из эпитетов, относящихся к сокровенному знанию или к самому Всевышнему. Имя Гаип, таким образом, могло даваться ребёнку с пожеланием быть под защитой невидимого, или же как имя, подчёркивающее религиозный смысл.

Словообразовательная модель фамилии проста: к тюркскому имени Гаип добавлен русский патронимический суффикс -ов, образующий фамилии от основ, оканчивающихся на твёрдый согласный. Форма Гаипова — это притяжательное прилагательное в женском роде, буквально означающее «дочь (или жена) Гаипа». Такая модель массово закрепилась у народов Поволжья, Урала и Средней Азии после введения всеобщей паспортизации в Российской империи в XIX веке, когда тюркские имена адаптировали под русскую фамильную систему.

Географически фамилия Гаипова наиболее распространена среди татар, башкир и казахов. Встречается также у узбеков и туркмен. В России основной ареал — Татарстан, Башкортостан, Оренбургская и Челябинская области. Встречаются и варианты написания: Гаипова (через «а») и, реже, Гаипова (с ударением на второй слог), но орфографическая норма закрепила первый вариант.

Стоит отличать эту фамилию от внешне похожей Гаипова, которая может быть образована от имени Гаип (вариант того же корня) или от диалектного прозвища. Однако в случае с Гаиповой корень однозначно указывает на имя, а не на прозвище: в тюркской антропонимике имя Гаип фиксируется как самостоятельное, а не как производное от какого-либо нарицательного слова.

Социальный состав носителей фамилии типичен для крестьянских и мещанских родов Поволжья: предки Гаиповых, скорее всего, были земледельцами или ремесленниками, получившими фамилию по отцу при переписях. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.