Фамилия Галагуз происходит от мирского имени или прозвища, которое давали по природному явлению. В олонецких говорах бытовало слово «галага» — так называли туман или иней. Скорее всего, это слово пришло в русские диалекты из соседних финно-угорских языков: в карельском halla означает «ночные заморозки», а эстонское hall переводится как «иней». Человек по прозвищу Галагуз мог родиться в туманную или морозную погоду, либо его внешность или нрав ассоциировали с чем-то холодным, зябким или неясным, как туман.

Модель образования фамилии проста: к основе Галагуз прибавили нулевой суффикс, то есть фамилию не переделывали, а закрепили в форме прозвища. Такие фамилии без патронимических суффиксов (-ов, -ин) встречаются реже, но характерны для северных регионов, где прозвища нередко переходили в фамилии без изменений. География фамилии подтверждает связь с Русским Севером: основная масса носителей Галагуз исторически сосредоточена в Архангельской, Вологодской областях и Карелии.

Встречается и другая версия, по которой корень «галаг» мог быть связан с глаголом «галанить» — «шуметь, галдеть». Но эта гипотеза слабее: слово «галага» с конкретным значением «туман, иней» зафиксировано в диалектах, а прозвища от погодных явлений — распространённая модель для северных фамилий. Так что версия с туманом и инеем выглядит убедительнее.