Фамилия Галенина — женская форма, а её основа, мужская фамилия Галенин, образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от личного имени или прозвища с помощью суффикса -ин. Этот суффикс указывает на принадлежность: «чей сын?» — Галенин, то есть сын Галени. Сама основа «Галеня» — это, скорее всего, уменьшительная или просторечная форма от христианского имени Галактион (греч. «молочный», «млечный»). В народном обиходе длинные и редкие имена часто укорачивали: Галактион превращался в Галеню, а от него уже пошла фамилия.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с прозвищем Галёна. В некоторых русских говорах, особенно на севере и в Сибири, «галёной» или «галеной» называли небольшую галку, а также могли прозвать человека за смуглость, крикливость или суетливость — по ассоциации с птицей. Однако в пользу имени говорит то, что фамилии на -ин от крестильных имён в России встречаются гораздо чаще, чем от птичьих прозвищ.

У фамилии Галенин есть и однокоренные «родственники» — Галактионов, Галанкин, Галенков. Все они восходят к тому же корню «Галактион», но разными суффиксами. Если Галактионов — прямая и полная форма, то Галенин — результат народного сокращения, что делает её звучание более простым и «бытовым». Такие фамилии часто встречались среди крестьян и мещан центральной России, где сложные церковные имена переделывали на свой лад.

Географически фамилия Галенина не привязана к какому-то одному региону — носители встречаются от Вологодчины до Урала, что типично для фамилий, образованных от распространённых имён. В дореволюционных метрических книгах Галенины записаны и в крестьянских, и в мещанских сословиях, без явного дворянского следа. Так что, скорее всего, предки носителей этой фамилии были обычными людьми, которых при крещении нарекли Галактионом, а в быту звали Галеней.