Фамилия Галуненко — характерный пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели на -енко. Суффикс -енко в украинской ономастике выполнял роль патронимического показателя (буквально «маленький», «сын»). По этой схеме в XVI–XVII веках на Левобережной и Слободской Украине массово возникали фамилии от имени или прозвища отца. В основе Галуненко лежит имя Галун — так могли звать человека, и здесь возможны два основных пути.

Первый, наиболее вероятный: прозвище Галун происходит от слова «галун» — золотая или серебряная тесьма, нашивка на форменной одежде. В украинском языке это слово закрепилось через польское galon и восходит к французскому galon. Носитель прозвища мог быть портным, военным щёголем, любившим богатый мундир, или же человеком, который торговал галунами и позументом. В реестрах запорожских казаков и мещан Гетманщины XVII века такие прозвища встречаются — например, казак Галун упоминается среди реестров 1649 года.

Второй вариант, менее распространённый: связь с личным именем Галактион (в просторечии Галун, Галушка). В украинском языке имя Галактион сокращалось до Галун или Галушка, и от этой уменьшительной формы по тому же принципу «сын Галуна» возникала фамилия. Однако в пользу первой версии говорит то, что прозвищ по предметам одежды и ремеслу в украинской антропонимии гораздо больше, чем от имён с таким редким сокращением.

Географически фамилия Галуненко типична для центральных и восточных областей Украины — Полтавщины, Черкащины, Сумщины. В России она встречается реже, в основном как результат миграций XIX–XX веков. Интересная деталь: в старых метрических книгах фамилия могла писаться через «о» — Галуненко (с ударением на втором или третьем слоге), а в некоторых говорах — с двойным «н»: Галунненко, что усиливало экспрессивность прозвища.

Сословной принадлежности у фамилии нет — её носили и казаки, и крестьяне, и мещане. В отличие от дворянских фамилий на -ский, модель на -енко была демократичной и охватывала все слои украинского общества.