Фамилия Ганчин образована от имени Ганча — это болгарская народная форма канонических имён. Чаще всего Ганча выводят из Гавриила (древнееврейское «божественный воин»), реже — из Григория (древнегреческое «земледелец»). Обе версии имеют право на существование: в болгарской антропонимии усечённые и уменьшительные имена нередко обслуживали сразу несколько полных имён.

Словообразовательная модель простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Ганчин буквально означает «сын Ганчи» или «человек из рода Ганчи». Такая модель была особенно распространена в северных и центральных губерниях России, куда фамилия могла попасть вместе с переселенцами или через церковные записи.

Интересная деталь: имя Ганча встречается не только у болгар, но и у западных славян, например у чехов и словаков, где оно тоже служит сокращением от Гавриила. Однако в русском быту фамилия Ганчин редкая и почти не выходит за пределы нескольких регионов. По данным современных справочников, её носители сосредоточены в основном в Поволжье и на Урале — это говорит о том, что фамилия могла закрепиться в среде старообрядцев или переселенцев из южнославянских земель.

Суффикс -ин, а не -ов, подтверждает, что основа оканчивалась на -а, и это дополнительно указывает на разговорное, некалендарное происхождение прозвища или имени. В ономастике такие фамилии ценны тем, что сохраняют живую народную речь, почти не зафиксированную в письменных источниках.