Фамилия Ганчины происходит от личного имени Ганча — это болгарский вариант крестильного имени Гавриил, которое с древнееврейского переводится как «божественный воин». По другой версии, в основе лежит имя Ганча как вариант имени Григорий (с древнегреческого — «земледелец»). Какая из версий правдоподобнее, сказать сложно: обе возможны, и обе указывают на болгарские корни исходного имени.

Сама фамилия образована по типичной восточнославянской модели с суффиксом -ин. Такие фамилии обычно возникали от имен или прозвищ, оканчивающихся на -а или -я: Ганча → Ганчин, то есть «сын Ганчи» или «принадлежащий Ганче». Интересно, что суффикс -ин в русских фамилиях чаще встречается в северных и центральных регионах, а также в среде, где было много переселенцев из белорусских и украинских земель. Поэтому носители фамилии Ганчин могли жить в разных частях бывшей Российской империи, но исходный корень ведёт к болгарской антропонимии.

В отличие от многих фамилий на -ов, которые образуются от полных форм имён, Ганчин — редкий случай, когда основа усечена до народного, уменьшительного варианта. Это делает фамилию более личной, «домашней» по происхождению: предка звали не официально Гавриилом или Григорием, а по-свойски — Ганча.

О точном времени возникновения фамилии говорить трудно: процесс закрепления наследственных прозваний шёл несколько столетий, и в разных слоях населения завершился в разное время. Ясно одно: фамилия Ганчин — памятник не только письменности, но и живого народного словообразования, где церковное имя прошло через бытовую переработку и дало начало новой родовой линии.