Фамилия Ганчина образована от имени Ганча. Это одна из уменьшительных форм крестильного имени Гавриил, которое пришло из древнееврейского языка со значением «божественный воин». В болгарской традиции имя Ганча также могли связывать с именем Григорий — в переводе с древнегреческого «земледелец». Обе версии имеют право на существование: суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность («чей?»), то есть Ганчина — это «дочь или жена Ганчи». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а. Интересно, что фамилия Ганчина встречается реже, чем мужской вариант Ганчин, и может указывать на происхождение из областей, где были сильны болгарские или южнославянские влияния, либо на то, что предок носителя фамилии был человеком по имени Ганча.