Фамилия Ганджаева образована от мужского имени или прозвища Ганджа. Её основа не имеет ничего общего с русскими корнями: слово «ганджа» в тюркских языках означает «сокровище», «клад», «богатство». В азербайджанском и персидском языках это слово звучит как «гяндж» — отсюда и название города Гянджа в Азербайджане. Таким образом, прозвище Ганджа мог получить либо человек, владевший ценностями, либо уроженец этого города. Версия с географическим прозвищем выглядит правдоподобнее: в ономастике распространены фамилии, указывающие на место рождения или жительства предка.

Суффикс -ев указывает на русскую модель образования фамилий от тюркских основ. В XIX веке, когда у народов Кавказа и Закавказья начали массово фиксировать фамилии по русскому образцу, к основе добавляли суффиксы -ов/-ев, -ин, чтобы привести фамилию к привычной для имперской администрации форме. Ганджаев — типичный пример такой адаптации. Буква «а» на конце исходного имени сохранилась, поэтому фамилия звучит как Ганджаев, а не Ганджев.

Интересная деталь: в осетинском языке слово «гандз» означает «пшеница», но для фамилии Ганджаева эта версия менее вероятна. Осетинские фамилии чаще образуются с суффиксом -ты/-ти, а не -ев. Кроме того, распространение фамилии Ганджаева в Дагестане, Азербайджане и среди народов Северного Кавказа подтверждает именно тюркско-персидскую основу. Среди носителей этой фамилии много лезгин, аварцев, табасаранцев — народов, исторически контактировавших с тюркской и персидской культурой.

Носитель фамилии Ганджаева, скорее всего, потомок человека, которого звали Ганджа — либо по месту рождения (из Гянджи), либо по прозвищу, данному за богатство или щедрость. Фамилия не указывает на конкретное сословие: её могли получить и крестьяне, и торговцы, и ремесленники. Встречается она преимущественно на юге России и в Закавказье, реже — в центральных регионах.