Фамилия Ганижев — редкий случай, где сталкиваются сразу несколько версий происхождения, и ни одна из них не связана с привычным славянским именословом. Для её понимания нужно смотреть в сторону кавказских языков и диалектных названий растений.

Наиболее вероятная основа — ингушское слово «ган», «генаш», что означает «сон, сновидение». В этом случае Ганиж — прозвище любителя поспать, которое закрепилось за родоначальником. Такие прозвища по привычкам и характеру — один из древних пластов фамилий у народов Кавказа.

Вторая версия отсылает к диалектному названию аниса — однолетнего растения из семейства Зонтичные. Плоды аниса известны как лекарственное средство: они снимают спазмы гладкой мускулатуры кишечника, помогают при воспалении почек и мочевого пузыря, выводят песок из мочевыводящих путей. Применяли анис и при вздутии живота, для стимуляции поджелудочной железы и печени, а промывание глаз этим настоем, по народным поверьям, улучшало зрение. Если прозвище Ганиж дали знатоку таких трав, то основатель рода мог быть знахарем или травником, хорошо разбиравшимся в местной флоре.

Третья, менее вероятная гипотеза, связывает фамилию с арабским именем Гани — «очень богатый, состоятельный». В исламской традиции это один из эпитетов Аллаха. Диалектная форма Ганиж могла возникнуть на стыке языков, но эта версия уступает первым двум по объяснительной силе, поскольку не привязана к местной языковой среде.

Суффикс -ев указывает на русскую модель оформления фамилии, характерную для многих народов Северного Кавказа при интеграции в общероссийскую делопроизводственную систему. Таким образом, Ганижевы — это род, чьё прозвище уходит корнями либо в ингушский язык и бытовую наблюдательность, либо в народную ботанику и врачевание.