Фамилия Ганусин — наглядный пример того, как простое прозвище или уменьшительное имя, пройдя через века, закрепилось в виде родового имени. Её основа — Ганус — это не что иное, как народная, обиходная форма канонического имени Иоанн. В славянской среде имя Иоанн (в русском обиходе — Иван) давало десятки производных: Иванко, Ванечка, Ваня, а в западных и южных диалектах — Януш, Ганус. Форма Ганус характерна для украинского, белорусского и польского языкового пограничья. Фамилия образована по простейшей патронимической модели: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — «Ганусов сын», то есть сын человека по имени или прозвищу Ганус.

Менее распространённая, но возможная версия возводит основу к польскому слову ganas — «подбородок» или «челюсть», но в таком значении прозвище было бы скорее описательным, а не именным. Однако фамилии на -ин, образованные от прозвищ, обычно отталкиваются от существительных мужского рода на -а/-я (Губа — Губин, Сирота — Сиротин), а Ганус как раз заканчивается на согласную, что типично для усечённых имён. Поэтому версия с происхождением от имени Иоанн через промежуточную форму Ганус — основная и наиболее убедительная.

Интересно, что в отличие от массовых русских фамилий на -ов (Иванов, Петров), форма на -ин чаще встречается в северных и центральных регионах России, а также в среде, где было сильно влияние белорусской или украинской антропонимии. Носители фамилии Ганусин исторически могли быть выходцами из западных губерний Российской империи — Могилёвской, Витебской, Волынской. Сословно фамилия не маркирована: её мог получить как крестьянин, так и мещанин, поскольку в основе лежит распространённое личное имя, а не ремесло или социальный статус.

Однокоренные фамилии — Ганус, Ганущенко, Ганусевич — встречаются реже, но все они восходят к тому же корню. В написании Ганусин возможна вариация с одной буквой «с» (Ганусин) или удвоением (Ганнусин), но вторая форма исторически менее вероятна, так как имя Ганус не имело долгого согласного. Таким образом, фамилия Ганусин — это типичный пример «ивановской» фамилии, но с региональным колоритом: не Иван, а Ганус, не -ов, а -ин.