Фамилия Ганусова — женская форма, а её мужской вариант Ганусов. В русской традиции такие фамилии обычно образуются от имени или прозвища отца с помощью суффикса принадлежности -ов. Основа здесь — «Ганус», и ключевой вопрос в том, откуда взялось это слово.

Самая вероятная версия: Ганус — это народная, обиходная форма крестильного имени Иоанн (в русском обиходе — Иван). В некоторых говорах, особенно на западе и юге России, а также под влиянием белорусского и украинского языков, имя Иван могло преобразоваться в Ганус через чередование начального «И» на «Г» (ср. белорусское Ганна — Анна) и замену окончания. Суффикс -ус, редкий для русских имён, мог появиться под польским влиянием (сравните польские имена Януш, Ганус как уменьшительные от Ян). Таким образом, Ганусов — буквально «сын Гануса», то есть потомок Ивана.

Вторая, менее распространённая версия, связывает фамилию с немецким или еврейским корнем. В немецком языке существует фамилия Hanus (Ханус) — сокращение от Иоганнес. В славянской среде она могла адаптироваться в Ганус, а затем получить русский суффикс -ов. Такое случалось в регионах смешанного проживания, например, в Прибалтике или на Волыни.

Географически фамилия Ганусова встречается нечасто, но её очаги — это западные области России, а также Беларусь и Украина. В дореволюционных списках и переписях Ганусовы могли записываться как крестьяне или мещане, поскольку фамилия не несёт сословного оттенка и образована по простой патронимической модели. Интересно, что в некоторых старых документах встречается вариант написания с одной «с» — Ганусов, что только подтверждает неоднозначность происхождения (от имени или от иноязычной фамилии).