Фамилия Ганженко, вероятно, происходит от прозвища Ганжа. По одной из версий, оно образовано от диалектного украинского слова «ганджа» - «изъян», «физический недостаток, полученный в результате заболевания или повреждения организма, а также прирожденный». Следовательно, Ганжой могли называть калеку. Согласно другой гипотезе, фамилия Ганженко происходит от названия одного из населенных пунктов. По одной из версий, это слово означает «клад». Следовательно, основатель рода Ганженко мог быть выходцем из этой местности. Не менее известен и древний город Ганжа (Гянджа) – второй по величине город Азербайджана, основанный еще в VIII веке до н. Так, в Книге памяти Белгородской области записан хлебопашец Ганженко Михаил Сергеевич, который родился в 1898 году на хуторе Ясенов Ровеньского района Белгородской области. А в Книге памяти Пермской области упоминается украинец Ганженко Савелий Степанович, рожденный в 1874 году в деревне Пивневка (Меловский р-н, Сталинская обл.).