Фамилия Ганзиков — редкий случай, когда прозвище-основа может быть и литовской, и славянской, и даже немецкой, а суффикс — однозначно русский, указывающий на происхождение по отцу. Суффикс -ов в фамилии Ганзиков говорит о том, что предка звали Ганзик, и это был человек, скорее всего, из простонародья: модель «прозвище + -ов» в XVII–XIX веках была самой массовой среди крестьян и мещан.

Самая правдоподобная версия — происхождение от прозвища Ганза. В русских говорах «ганза» — это не только название средневекового торгового союза, но и местное слово, означавшее «карман» или «кошель» (от немецкого Hansa через польское посредство). Соответственно, Ганзик — человек с большим кошельком, либо, наоборот, тот, кто постоянно лезет в чужой карман. Уменьшительный суффикс -ик здесь не столько ласкательный, сколько указывает на конкретного носителя признака: «тот, кто связан с ганзой».

Менее вероятная, но не исключённая версия — от литовского слова gandras (аист). В литовском языке есть фамилии Гандравичюс, а в русской адаптации могло возникнуть Ганзик через замену звуков. Если предки жили на западных рубежах России, в Смоленской или Псковской губерниях, где издавна соседствовали литовские и белорусские говоры, такое заимствование возможно. В таком случае Ганзик — это человек с длинными ногами или, в переносном смысле, приносящий удачу.

Встречается фамилия Ганзиков в основном на юге России и в Поволжье — в Волгоградской, Ростовской областях, в Краснодарском крае. Это согласуется с первой версией: прозвища, связанные с торговлей и деньгами, были распространены среди казачества и купечества. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — в родословных книгах её нет, что подтверждает позднее, крестьянское или мещанское происхождение.