Фамилия Гаппаров образована от мужского тюркского имени Гаппар, которое в переводе с арабского означает «прощающий, милосердный». Вероятно, родители, нарекая ребенка таким именем, как Гаппар, желали своему сыну стать достойным мусульманином. Таким образом, потомок человека, которого звали Гаппар, со временем получил фамилию Гаппаров.