Фамилия Гарагус — редкий случай, когда прозвище, скорее всего, не славянского, а тюркского или греческого происхождения, но при этом оформлено по русской модели. В отличие от большинства русских фамилий на -ов/-ин, эта фамилия сохранила «голую» основу без патронимического суффикса, что указывает на её позднее закрепление или на то, что она могла прийти из среды, где фамилии фиксировали в уже сложившемся виде.

Разберём основу. «Гарагус» явно членится на две части: «гара» и «гус». Первая часть — «гара» — в тюркских языках (татарском, башкирском, казахском) означает «чёрный», «тёмный», «сильный» (ср. кара). Вторая часть «гус» может восходить к тюркскому «куш» (птица) или «гуз» (гусь), либо быть искажённым русским «гусь». В тюркской ономастике распространены прозвища типа «Каракуш» (чёрная птица), «Карагуз» (чёрный глаз). Если исходная форма — «Карагус», то при переходе в русскую среду начальное «к» могло озвончиться в «г» под влиянием южнорусских говоров (характерное для украинского и донских диалектов). Тогда прозвище «Чёрный гусь» или «Чёрная птица» могло принадлежать либо человеку с тёмными волосами и смуглой кожей, либо тому, кто держал чёрных гусей, либо охотнику на дичь.

Есть и другая версия — греческая. На юге России, в Приазовье и Крыму, встречаются греческие фамилии на -ус: Паппус, Харалампус. «Гарагус» может быть русифицированной формой греческой фамилии, где «гара» — искажённое «хара» (радость, благодать) или «Гера» (имя). Однако эта гипотеза слабее, так как в греческом языке нет типичного окончания «-гус», а сочетание «гара» нехарактерно для греческих корней.

Географически фамилия Гарагус встречается в основном на юге России: в Ростовской области, Краснодарском крае, Ставрополье. Это подтверждает связь с казачьими территориями, где активно смешивались русские, украинские и тюркские элементы. Носители фамилии, скорее всего, были донскими или кубанскими казаками, получившими прозвище от соседей-татар или ногайцев. Суффикса -ов нет, что говорит о том, что фамилия закрепилась в устной форме без переосмысления как «сын такого-то» — её просто записали так, как слышали.

Таким образом, наиболее правдоподобное объяснение: Гарагус — это тюркское прозвище «Карагус» (чёрная птица), которое в русской среде утратило начальное «к» и стало фамилией без дополнительных суффиксов. Предки носителей могли быть казаками или крестьянами южных губерний, контактировавшими с тюркоязычным населением.