Фамилия Гарконица — редкий случай, когда написание почти полностью совпадает с произношением, но происхождение при этом остаётся неочевидным. В ней нет ни одного из распространённых восточнославянских фамильных суффиксов (-ов, -ин, -ский), что сразу отводит взгляд в сторону западнославянских или балтийских моделей.

Основа «Гаркон-» с большой вероятностью восходит к польскому или белорусскому диалектному слову. В польском языке есть глагол «garknąć» — рявкнуть, гаркнуть. Соответственно, «Гарконица» могла быть прозвищем человека с громким, резким голосом или вспыльчивым нравом. Окончание «-ица» в такой модели характерно для фамилий, образованных от прозвищ с суффиксом принадлежности: «сын (или дочь) того, кого звали Гарконя». То есть сначала существовало прозвище Гарконя (тот, кто гаркает), а от него уже пошла фамилия Гарконица.

Менее вероятная, но допустимая версия — связь с географическим названием. В Польше и на западе Беларуси встречаются топонимы вроде Гарконы, Гарконя, от которых житель мог получить прозвище «Гарконица» («тот, кто из Гаркон»). Однако такой вариант требует подтверждения конкретной местной традицией, а фамилия слишком редка, чтобы делать на него ставку.

Суффикс «-ица» в конце фамилии встречается в нескольких контекстах. У южных славян (сербы, хорваты) это типичный фамильный суффикс, но там основа обычно звучала бы иначе. В восточнославянской среде «-ица» чаще встречается в прозвищах или неофициальных именованиях, которые потом закрепились как фамилии. Это мог быть вариант, когда фамилию дали не по отцу, а по прозвищу самого человека — что реже, но встречается в среде мелкой шляхты или крестьянства на границе польского и белорусского влияния.

Таким образом, наиболее правдоподобная версия: предок носителя фамилии Гарконица получил прозвище Гарконя за громкий голос или резкий характер, и это прозвище, перейдя в фамилию, сохранило свою первоначальную форму без типичных русских суффиксов. Фамилия имеет западнорусские или польские корни и бытует преимущественно в регионах исторического контакта восточнославянских и западнославянских диалектов.