Фамилия Гаврилишын — один из редких примеров, когда на письме сохранили древнюю восточнославянскую модель образования «от имени отца». Её основа — крестильное имя Гавриил (в просторечии Гаврила), а суффикс -ышын — это вариант притяжательного суффикса -ин, который в русском языке закрепился в формах «чей?». Но здесь не обычное «Гаврилин», а «Гаврилишын»: словообразовательная цепочка длиннее. Сначала от имени Гаврила образовали уничижительную или уменьшительную форму Гаврилиш (по аналогии с Васька → Васькин, но с суффиксом -иш-), а затем от неё — «Гаврилишын», то есть «сын Гаврилиша».

Такой суффикс (-ышын, -ихин, -ыгин) в русских фамилиях встречается редко и чаще всего в северных и северо-восточных говорах — в Архангельской, Вологодской, Вятской губерниях. Там патронимы на -их(а) и -ыш(а) были живой нормой: «ты чей? — Гаврилишын». То есть предок носителя фамилии был не просто Гаврила, а Гаврилиш — возможно, так в семье звали младшего или того, кто носил имя с пренебрежительным оттенком (в диалектах «Гаврилиш» могло значить «неказистый Гаврила»).

Сам корень — библейский Гавриил («сила Божья»). Имя было одним из самых распространённых на Руси, поэтому фамилий с корнем Гаврил- много: Гаврилов, Гаврилин, Гаврильченко, Гаврилец. Но Гаврилишын стоит особняком: она не столько «сын Гаврилы», сколько «сын того, кого звали Гаврилиш». Это указывает на узкий круг бытования — скорее всего, фамилия возникла в одной локальной группе и не разошлась широко. В современных базах данных она встречается единично, что подтверждает её редкий, почти «домашний» характер.

Если искать географию, то, по косвенным данным, носители фамилии Гаврилишын фиксируются на Украине и в южных областях России — туда она могла попасть с переселенцами из северных губерний. Но из-за редкости фамилии точную привязку к одному уезду или селу установить сложно.