Фамилия Геноев образована от имени Гено. Это имя встречается у ингушей, грузин и армян, что сразу указывает на её южное, кавказское происхождение. Скорее всего, Гено — это краткая, обиходная форма от канонического имени Геннадий. В переводе с греческого языка Геннадий означает «человек из благородного рода», «благородный». Одним из покровителей этого имени считается Геннадий Константинопольский — патриарх, живший в I веке. По преданию, он исцелил руку живописца, который дерзнул изобразить лик Спасителя похожим на языческое идольское лицо.

Фамилия строится по простой модели: к основе Гено прибавляется суффикс принадлежности -ев. Этот суффикс характерен для русских фамилий, образованных от основ на мягкий согласный или на -й. Здесь он указывает на патронимическое происхождение: «чей?» — Геноев, то есть сын или потомок Гено. Таким образом, в фамилии скрестились две языковые традиции: кавказское имя и русский способ оформления родового прозвания.

Примечательно, что фамилия не получила широкого распространения. В отличие от массовых Геннадьевых или Генниных, Геноевы встречаются реже и сохраняют более тесную привязку к региону. Это объясняется тем, что имя Гено как самостоятельное бытовало в основном в национальных средах, а фамилию по нему давали уже при переходе в русскоязычную документацию. Потомок человека по имени Гено со временем и получил фамилию Геноев, закрепившую за ним память о предке.