Фамилия Германков — нечастая, но прозрачная по устройству. Её основа — имя Герман, а суффикс -ков указывает на принадлежность: «чей?» — Германков, то есть сын или потомок Германа. В русской ономастике это типичная «патронимическая» модель, та же, что у Ивановых или Петровых, только с менее распространённым корнем.

Имя Герман пришло на Русь вместе с христианством из Византии. В переводе с латыни (Germanus) оно означает «единокровный», «родной». В православных святцах известно несколько святых с этим именем, например, Герман Константинопольский или Герман Валаамский. Однако в крестьянской среде имя долго оставалось редким, чаще встречалось у духовенства и мещан. Поэтому фамилия Германков могла возникнуть в среде, где имя давали не по народной традиции, а по церковному календарю.

Суффикс -ков, а не -ов, указывает на то, что основа оканчивалась на твёрдый согласный (Герман — Германков). В говорах возможна была и форма Германкин (от уменьшительного Германка), но вариант с -ков — литературный и более старый. Если сравнить с фамилиями Германов, Германцев, то Германков — самая прямая патронимическая форма: она не добавляет дополнительных суффиксов, просто «притягивает» окончание.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу и центру России: в псковских, тверских, новгородских писцовых книгах XVII века встречаются крестьяне и посадские с именем Германко — именно от такой народной формы и пошёл Германков. В XIX веке носители фамилии фиксировались в Смоленской, Калужской и Вологодской губерниях, но нигде не образовывали крупных гнёзд. Дворянских родов с этой фамилией не было — она оставалась простонародной.

В современном написании важно не путать с украинским вариантом Германчук или польским Германовский. Фамилия Германков — чисто русская по модели, хотя имя-основа интернациональное. Её носители — потомки тех, кого в семье звали просто Германом, без прозвищ и ремёсел.