Фамилия Герне — одна из тех, чьё происхождение уходит корнями в немецкую языковую и географическую среду. Самая прямая версия: её образовали от названия населённого пункта. Герне (нем. Herne) — это деревня, которая находилась в прусской провинции Вестфалия, в округе Арнсберг. Если принять эту гипотезу, предок носителя фамилии был выходцем оттуда. Такие «топонимические» фамилии часто давали переселенцам, чтобы указать, откуда человек прибыл на новое место.

Есть и другая, более редкая возможность. В основе фамилии могло лежать немецкое слово gern — «охотно». Тогда прозвище Герне мог получить человек доброжелательный, готовый помочь близким без лишних уговоров. Такое прозвище закреплялось за характером, а не за местом рождения.

С точки зрения словообразовательной модели, фамилия представляет собой чистую основу без русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), что типично для фамилий немецкого происхождения, которые вошли в русский обиход без адаптации. Сравните с однокоренными, но уже русифицированными вариантами вроде Гернев — их встречается гораздо меньше. Сама фамилия Герне в России редкая, и её география, скорее всего, связана с местами расселения немецких колонистов (Поволжье, юг Украины, Петербургская губерния), хотя точных статистических данных по сословиям нет.