Фамилия Герций — редкий случай в русском ономастиконе, и её разговор стоит начать не с корня, а с суффикса. Окончание -ий типично для русских фамилий польского или южнославянского происхождения (сравните: Навецкий, Ковальский), но здесь его нет — это чистое -ий, как в фамилиях типа Троцкий или Бельский. Однако в основе лежит не географическое название, а личное имя или прозвище. Скорее всего, перед нами латинизированная или полонизированная форма от имени Герц (Herc) — краткой формы от Герберт или Герман, распространённой у немцев и евреев-ашкеназов. В польской традиции суффикс -ий часто передавал принадлежность: «Герций» могло означать «сын Герца» или «человек из рода Герца».

Другая версия, менее вероятная, но допустимая — связь с немецким словом Herz (сердце). В таком случае фамилия могла возникнуть как прозвище доброго или смелого человека, но для славянской среды такое прямое заимствование маловероятно: обычно прозвища переводились или адаптировались через уменьшительные формы. Куда правдоподобнее, что Герций — это русифицированная запись фамилии немецкого или еврейского переселенца, которую в документах записали на слух, с типичным для восточнославянской бюрократии окончанием -ий.

В Российской империи фамилия встречалась в основном среди мещан и купцов западных губерний — Волынской, Подольской, Киевской, где было много немецких колонистов и еврейского населения. Это не дворянский род: в «Общем гербовнике» Герции не значатся. В советское время фамилия почти исчезла из-за эмиграции и ассимиляции носителей. Сегодня она крайне редка, и её обладатели, скорее всего, потомки тех самых переселенцев, чья фамилия сохранила в себе память о немецком или польском корне, записанном русскими буквами.