Фамилия Глоталина образована от прозвища Глотала. В основе лежит глагол «глотать» — по В. И. Далю, «проглатывать, поглощать». Скорее всего, Глоталой в народе называли обладателя отменного аппетита. Однако есть и другая версия: в архангельских говорах словом «глот» обозначали человека, склонного к пьянству, а также обидчика. Если принять эту версию, прозвище Глотала могло быть охранительным, внутрисемейным — своеобразным оберегом. Родители нарекали сына Глоталой в надежде, что он вырастет добропорядочным и положительным, а дурное прозвище отпугнет злые силы.

Прозвище закрепилось за человеком как основное именование, а со временем через суффикс -ин дало фамилию. Модель образования простая: от основы на -а (Глотала) притяжательный суффикс -ин указывает на принадлежность «сын Глоталы». Такая схема типична для русских фамилий, возникших в крестьянской среде в XV–XVII веках.

Родственные именования встречаются в исторических источниках. С. Б. Веселовский упоминает крестьянина Глоткина Фому (1473 год, Звенигород) и помещиков Глотовых (конец XV века, Новгород). Глоталины — более редкий вариант того же корневого гнезда. Фамилия не получила широкого географического распространения, что говорит о её локальном происхождении, возможно, из северных или центральных областей России.