Фамилия Глубоковских происходит от прозвища Глубоковский. Оно ведет свое начало от топонима Глубоково - такое название носят несколько деревень и сел в России. Сам топоним Глубоково, очевидно, связано с прилагательным «глубокий». Обычно глубоким называют нечто бескрайнее, необозримое, имеющее большую глубину. Поэтому можно предположить, что Глубоково располагалось в низменности или же находилось далеко от крупных населенных пунктов. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Глубоковский, со временем получил фамилию Глубоковских.