Фамилия Гнусарьков — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, сохранилось почти без изменений, а суффикс указывает на конкретную модель родства. Разберём её по частям.

Корень здесь — «гнусарь». В русских говорах «гнус» — это мошкара, комарьё, гнус. Соответственно, «гнусарь» — человек, который либо живёт в гиблых, болотистых местах, где много гнуса, либо сам по себе назойливый, приставучий, «кусачий» в переносном смысле. В ряде диалектов слово «гнусарь» зафиксировано и как прозвище ворчливого, брюзгливого человека — того, кто «гнусит» (говорит в нос или постоянно жалуется). Таким образом, основа фамилии уходит в народную характеристику: либо по месту жительства (житель «гнусного» края), либо по поведению.

Суффикс «-ьков» — это форма родительного падежа от «-ьк». В русской антропонимии фамилии на «-ов» и «-ев» означают «чей?» — сын такого-то. «Гнусарьков» буквально значит «сын Гнусарька». А форма «Гнусарёк» — это уменьшительно-ласкательное или уничижительное от «Гнусарь». То есть фамилия образована не напрямую от прозвища Гнусарь, а от его производной формы — Гнусарёк. Такая модель (с двойным суффиксом) встречается реже, чем просто «Гнусарев». Она указывает, что предок носителя фамилии был в семье младшим, или же прозвище закрепилось в уменьшительной форме, чтобы смягчить неблагозвучность.

Географически фамилия тяготеет к северным и центральным областям России — Архангельской, Вологодской, Костромской, где слово «гнус» было в ходу, а болотистая местность давала повод для таких прозвищ. Встречается она нечасто, что делает её ценной для локальной истории: носители, скорее всего, происходят из одного небольшого рода.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Гнусарев, Гнусин, Гнусов) показывает, что «Гнусарьков» стоит особняком. Если Гнусарев — просто «сын Гнусаря», то Гнусарьков — «сын Гнусарька» — более конкретная и, возможно, более поздняя форма, закрепившаяся в документах именно в таком виде. Никаких дворянских корней или известных исторических личностей с этой фамилией не зафиксировано — это типичная крестьянская или мещанская фамилия, возникшая в среде, где прозвища давали метко и без обиняков.