Фамилия Гоголенко образована от мирского имени или прозвища Гоголь. В основе лежит нецерковное имя, которое было широко распространено в старину наряду с крестильными именами. Само слово «гоголь» имеет несколько значений, и каждое могло стать поводом для прозвища.

Самое известное из них связано с выражением «ходить гоголем» — держаться важно, величаво, с напыщенным видом. Такое прозвище могли дать спесивому или заносчивому человеку. Кроме того, в народной речи «гоголь» означало также «щеголь», «франт» или «волокита», так что прозвище могло указывать на любовь к нарядам и ухаживаниям.

В «Ономастиконе» С.Б. Веселовского зафиксированы ранние примеры этого имени: Иов Гоголь, крестьянин (1495 год, Новгород), и Дмитрий Гоголев, прасол (1554 год, Двина). Прасол — это скупщик скота или рыбы, что говорит о том, что носители этого имени принадлежали к разным сословиям.

Фамилия Гоголенко образована по распространённой украинской модели с суффиксом -енко. Этот суффикс первоначально означал «маленький», «сын» или «потомок». То есть Гоголенко — буквально «потомок Гоголя» или «сын Гоголя». Такая модель фамилий особенно характерна для Левобережной Украины и исторических земель Войска Запорожского. В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые закрепились в основном в великорусских землях, фамилии на -енко указывают на южное, украинское происхождение рода.

Таким образом, фамилия Гоголенко напрямую связана с прозвищем, которое описывало характер или манеру поведения предка. Потомок человека по прозвищу Гоголь со временем получил фамилию Гоголенко, и она закрепилась за его родом.