Фамилия Гогуноков — редкий случай, когда географическая привязка почти наверняка перевешивает все прочие версии происхождения. Если вы носите эту фамилию, ваши предки с большой вероятностью происходят с Северного Кавказа, а точнее — из балкарского или карачаевского рода.

Словообразовательная модель здесь нехарактерна для великорусских фамилий. Суффикс -ов указывает на русскую адаптацию, но основа «Гогунок» явно иноязычная. В русском языке слово «гогун» не встречается, а вот в тюркских языках, на которых говорят балкарцы и карачаевцы, есть имя Гогун или Гогунок. Это уменьшительная форма от древнего имени, которое, по одной из версий, восходит к тюркскому «кёк» — «голубой», «небесный», «синий». В тюркской ономастике синий цвет часто связывали с небом, божественным началом, и такие имена давали как обереги.

Вторая, менее распространённая версия отталкивается от диалектного русского слова «гогун» — так в некоторых говорах называли самца глухаря или тетерева (сравните с «гогот», «гоготать»). Прозвище Гогун мог получить человек с громким голосом или крикливый. Однако эта версия слабее: во-первых, слово «гогун» в значении «птица» крайне локально, во-вторых, для фамилии на -ов ожидалась бы форма Гогунов, а не Гогуноков. Уменьшительный суффикс -ок (Гогунок) в русских прозвищах обычно указывает на молодого или маленького — «сын Гогуна», но в сочетании с редким корнем это выглядит искусственно.

Более правдоподобно, что при оформлении фамилии в русских метрических книгах балкарскую фамилию Гогунланы (буквально «из рода Гогуна») записали через русский суффикс -ов, а конечное -ок — это адаптированная тюркская уменьшительная частица. Подобный путь прошли многие горские фамилии, оканчивающиеся в оригинале на -ланы, -ула: при переводе в российское делопроизводство их «обрусели», сохранив внутреннюю форму.

Сословно предки Гогуноковых, скорее всего, относились к свободным горцам-общинникам или узденям (дворянскому сословию в балкарском обществе). Точных данных о знаменитых носителях фамилии нет — это не фамилия дворянских родов, внесённых в родословные книги, а типичная фамилия сельских общин, которая сохранилась в горах Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии.

Таким образом, если вы Гогуноков, ваша фамилия — живое свидетельство того, как тюркское родовое имя, означавшее «потомок Гогуна (Синего/Небесного)», было переписано русскими чиновниками и закрепилось в форме, которую сейчас разгадывают этимологи.