Фамилия Голонова — редкая и неочевидная. Её основа, прозвище Голон, скорее всего, связана не с русским словом, а с библейской географией. Голон — это древний город в наделе колена Иегуды (территория современного Израиля). Название города происходит от еврейского «холот» — «пески». Так могли прозвать уроженца этого места или человека, имевшего к нему какое-то отношение.

Притяжательный суффикс -ов указывает на принадлежность: Голонова буквально значит «дочь (или жена) Голона». Модель образования типична для русских фамилий, но корень здесь иноязычный, что встречается реже. В русских говорах слово «голон» не зафиксировано, поэтому версия с топонимом выглядит правдоподобнее, чем связь с диалектным прозвищем.

В ономастических справочниках фамилия Голонова не описана подробно, но её структура позволяет уверенно отнести её к группе «географических» прозвищ, которые давали переселенцам или людям, связанным с чужими землями. Такие фамилии часто возникали в среде духовенства или купечества, имевшего контакты с восточными регионами. Прямых данных о сословной принадлежности носителей фамилии нет, но сама необычность корня говорит о том, что предок был человеком с определённым кругозором или происходил из семьи, сохранившей память о дальних корнях.