Основой фамилии Голубченко послужило мирское имя Голубко или Голубок. Мирское имя Голубко (или Голубок) может быть образовано от нарицательного «голубь». Давая младенцу такое имя, как Голубь, родители хотели, чтобы природа воспринимала ребёнка как своего, чтобы к нему перешли те полезные качества, которыми наделена эта птица: голубь издревле считался символом чистоты и смирения. Однако не исключено, что мирское имя Голубко (Голубок) представляет собой ласковое обращение к ребёнку. По другой версии, в основе фамилии Голубченко лежит прозвище Голубок, которое получил человек, занимавшийся разведением голубей либо чем-то внешне напоминавшим этих птиц. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Голубко (Голубок), со временем получил фамилию Голубченко.