Фамилия Голубчин — редкий случай, когда прозвище перешло в фамилию почти без изменений, сохранив уменьшительно-ласкательный суффикс. В основе лежит слово «голубь» — птица, издавна символизировавшая кротость, мир и чистоту. Однако прозвище Голубь на Руси давали не только за мягкий нрав. Часто так называли человека с голубыми глазами — цветом, который в старину не выделяли отдельным словом, а описывали через сравнение с оперением птицы. В северных и сибирских говорах «голубем» могли прозвать и того, кто разводил голубей, или просто любителя этой птицы.

Суффикс «-чин» в фамилии заслуживает отдельного внимания. Это не типичный «-ин» (как в Голубев или Голубкин), а более редкий патронимический формант, характерный для ряда русских фамилий, особенно из бывших удельных княжеств (рязанские, тульские, калужские земли). Он образован по модели «чей?»: Голубча — так могли в быту называть сына или внука Голубка. Другими словами, Голубчин — это «сын Голубка», где «Голубок» — уменьшительное от Голубь. Фамилия закрепилась в форме родительного падежа множественного числа: «из рода Голубчей» — Голубчин.

В отличие от массовых Голубевых, фамилия Голубчин довольно редкая. Она не встречается в крупных дворянских родословных книгах, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Основной ареал бытования — центральные области России, особенно Рязанская и Тамбовская губернии, где суффикс «-чин» был распространён. Встречаются также варианты написания через «ы» — Голубцын, но это уже другая ветвь, образованная от «голубец» (так в некоторых регионах называли голубя или сизый цвет).

Словарь Б. Унбегауна относит подобные фамилии к группе «патронимических на -ин», но с оговоркой: форма на «-чин» — результат стяжения и редукции, когда полное «Голубечин» (от Голубец) со временем упростилось. Впрочем, более вероятно, что исходным было прозвище Голубча — ласкательное обращение к ребёнку или подмастерью, которое закрепилось за родом.