Фамилия Голубенький — яркий пример того, как цветовое прозвище превратилось в фамилию, сохранив при этом уменьшительно-ласкательный оттенок, который в русском языке обычно передаёт суффикс -еньк-. В отличие от массовых фамилий на -ов и -ин, эта модель образования (прилагательное с суффиксом -еньк-) встречается реже и чаще фиксируется в южнорусских и украинских говорах, где вообще любили прозвища с эмоциональной окраской.

Основа здесь — прилагательное «голубенький». Но вряд ли предка так назвали за цвет глаз или одежды. Скорее всего, прозвище относилось к человеку кроткого, мягкого нрава, «голубиного» — незлобивого и тихого. В народной речи «голубчик», «голубка» были ласковыми обращениями, и фамилия могла закрепиться за тем, кого в семье или деревне постоянно так называли. Вторая версия — связь с голубями как домашней птицей: предок мог разводить голубей или просто любить их, но здесь «голубенький» звучит скорее как прозвище по характеру, а не по ремеслу.

Интересно, что фамилия не получила патронимического окончания — не стала Голубеньков или Голубенькин. Это говорит о её позднем оформлении: в XIX веке, когда крестьянам массово давали фамилии, могли записать прозвище в чистом виде, без суффикса принадлежности. Такие «окаменевшие» прилагательные характерны для украинской ономастики (сравните: Бойкий, Весёлый), но встречаются и у русских, особенно на юге России.

Словарь русских фамилий Б. Унбегауна относит подобные образования к числу «семейных прозвищ», которые не меняли форму по падежам, как обычные фамилии на -ов. Голубенький — одна из тех фамилий, где за ласковым звучанием стоит простая деревенская история: человека прозвали по доброму нраву, и это прозвище пережило века.