Фамилия Голубокий — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано не с цветом глаз, а с конкретным ремеслом или местом. На первый взгляд корень «голуб» заставляет думать о голубоглазом человеке, но суффикс -ок- (Голубок) указывает на уменьшительно-ласкательную форму, а окончание -ий — на притяжательное прилагательное. Слово «голубок» в старых русских говорах означало не только птенца голубя, но и мастера по изготовлению голубей — деревянных или глиняных игрушек, которые делали на продажу. В некоторых регионах так называли человека, который разводил голубей для охоты или забавы. Вероятнее всего, Голубокий — это сын или потомок Голубка, то есть человека, носившего такое прозвище по роду занятий.

Модель образования фамилии — от прозвища на -ок через притяжательное прилагательное на -ий. Такая схема характерна для украинских и южнорусских фамилий, где окончание -ий часто вытесняло более привычное -ов. В русской ономастике фамилии на -окий встречаются реже, чем на -ов или -ин, и обычно указывают на прозвищное происхождение, а не на отчество от крестильного имени. Если бы фамилия образовалась от имени Голуб (редкое неканоническое имя), мы бы ждали форму Голубов или Голубин.

География бытования подсказывает, что фамилия Голубокий могла закрепиться в тех краях, где было развито кустарное производство игрушек, — например, в некоторых уездах Владимирской, Нижегородской или Вятской губерний. Однако точных статистических данных по этой фамилии в открытых источниках мало, что подтверждает её редкость. Встречаются и варианты написания: Голубков, Голубенко, но Голубокий — именно с таким суффиксом — стоит особняком.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Голубев, Голубцов) показывает разницу в социальном контексте: Голубев — отчество от прозвища Голубь (возможно, кроткий человек), а Голубокий — более конкретное, «профессиональное» прозвище, которое давали человеку, чей труд был связан с голубями. Таким образом, предок нынешних Голубоких, скорее всего, не выделялся цветом глаз, а имел дело с птицами или их изображениями.