Фамилия Голушкова — женская форма фамилии Голушков, и её происхождение напрямую связано с прозвищем или именем Голушка. В основе лежит слово «голый» или производные от него, но не стоит сразу представлять себе бедняка: в русских говорах «голушка» могло быть ласковым обращением к человеку с короткой стрижкой, бритой головой или даже к неимущему, но чаще — к простому, открытому, «голому как сокол» человеку. Суффикс -к- в прозвище Голушка типичен для уменьшительно-ласкательных форм, которые в XV–XVII веках легко становились основой для фамилий.

Словообразовательная модель проста: прозвище Голушка плюс патронимический суффикс -ов, то есть Голушков — сын Голушки. Фамилия образована по стандартной для центральной России схеме, характерной для крестьянских и посадских родов. Интересно, что в отличие от фамилий на -ин (Голушкин), форма на -ов указывает на основу, оканчивающуюся на согласный: Голушк-а → Голушк-ов. Встречается и вариант Голушков, и Голушкова — в женском роде, по правилам русской грамматики.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и поволжским областям, где слово «голушка» бытовало особенно активно. В архивных записях XVII–XVIII веков можно встретить крестьян с таким прозвищем в Тамбовской, Рязанской и Саратовской губерниях. В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» модель «основа на -ка + -ов» описана как одна из самых распространённых, но именно с корнем «гол-» она встречается реже, чем, скажем, Голубев или Голованов.

Стоит упомянуть и альтернативную, менее вероятную версию: в некоторых говорах «голушка» называли вид птицы — галку или галчонка. Но эта гипотеза слабая, так как для птиц чаще использовали суффикс -к- в ином значении (галка, голубка), а прямое звуковое совпадение с «голый» даёт больше оснований. Поэтому предки Голушковых, скорее всего, получили прозвище за внешность или характер — лысоватый, простой, бесхитростный человек, которого в деревне ласково называли Голушкой.