Фамилия Голыньков — яркий пример того, как прозвище, данное по внешности или образу жизни, закрепилось в родовом имени. В её основе лежит слово «голый», но не в прямом, а в переносном, часто ироничном смысле. «Голынь» или «голынька» — так на Руси называли бедняка, человека, у которого «ни кола, ни двора», то есть буквально «голь перекатная». Прозвище Голынь, Голынька или Голыня мог получить крестьянин, не имеющий собственной земли и скота, либо человек, ходивший в рваной, бедной одежде. Суффикс -к- в основе («Голыньк-») — уменьшительно-пренебрежительный, он усиливал оттенок несерьёзности или жалости к такому положению.

Фамилия образована по стандартной для русских фамилий модели: к прозвищу Голынька (или Голынько) добавили патронимический суффикс -ов. Таким образом, Голыньков — это «сын Голыньки». Форма на -ов указывает на то, что фамилия складывалась в центральных и северных регионах России, где был распространён именно этот суффикс, в отличие от украинских или белорусских земель, где чаще использовали -енко или -ук.

Интересно, что фамилия Голыньков — довольно редкая. Она не встречается в списках массовых дворянских родов и, скорее всего, имела крестьянское или мещанское происхождение. Прозвища, связанные с бедностью, давали не в насмешку, а как констатацию факта — в среде, где большинство жило небогато, такое имя не было оскорблением. Со временем, когда потомки «Голыньки» могли разбогатеть или переселиться, фамилия осталась, превратившись из характеристики в нейтральный родовой знак.

С точки зрения словообразования, Голыньков стоит в одном ряду с фамилиями Голышев, Гольцов, Голяков — все они восходят к тому же корню «гол-» и описывают сходные социальные или физические черты. Но именно суффикс -ыньк- придаёт фамилии особый оттенок: он характерен для прозвищ, образованных от прилагательных с ласкательным или уменьшительным значением (сравните: «голынька» — как «малынька»). То есть предка, скорее всего, звали не просто «Голый», а именно «Голынька» — с оттенком сожаления или даже шутливой ласки.