Фамилия Голынькова образована от прозвища Голынько. В основе лежит слово «голынь» — бедность, нищета. Скорее всего, прозвище указывало на небогатого человека, но здесь есть и другая, бытовая логика. В крестьянской среде такие «отрицательные» имена нередко давали как оберег: родители нарекали сына Голыньком в надежде, что злые силы не позарятся на бедняка, а мальчик вырастет здоровым и обеспеченным. Это охранительная народная традиция, и в случае с этой фамилией она выглядит убедительнее, чем прямое указание на нищету.

Менее очевидная, но более редкая версия связывает прозвище с топонимом Голынь. В древнерусских источниках встречается упоминание о Голыни (или Голуни) — так называли город в скифских степях, который археологи отождествляют с Бельским городищем на реке Ворскле. Слово «голунь» в этом контексте означало «столица». Если принять эту гипотезу, то Голынько — прозвище выходца из той местности. Однако для фамилий с суффиксом -ко, характерных для украинских и белорусских земель, связь с конкретным древним городищем — скорее исключение, чем правило. Гораздо чаще такие прозвища рождались из бытовых черт.

Модель образования проста: суффикс -ко в прозвище Голынько типичен для юго-западных регионов, а затем фамилия адаптировалась под русскую грамматику с помощью суффикса -ов, дав форму Голыньков. Женский вариант Голынькова закрепился в документах как стандартная форма для женщин. Сравните с однокоренными Голышев, Гольцов, Голенков — все они выросли из той же темы «голь», бедность, но у каждой своя суффиксальная история. Голынькова стоит особняком именно из-за редкого сочетания уменьшительного -ыньк-, которое придаёт прозвищу не столько уничижительный, сколько бытовой, «домашний» оттенок.