Фамилия Гонорацкий звучит необычно для русского уха — в ней слышится что-то книжное, почти латинское. И это не случайно: её основа напрямую связана с латинским словом honor — «честь», «почёт», «уважение». В русский язык оно проникло через польское посредничество, где honorny означало «почётный», а honorny czlowiek — «человек чести». От этого же корня образованы более привычные нам «гонор» (в значении «чувство собственного достоинства» или «заносчивость») и «гонорар» (почётный дар, плата за труд).

Суффикс -цк- (в форме -ацк-) — типичный для польских и западнорусских фамилий, указывающий на географическое происхождение или принадлежность к месту. В польской ономастике множество фамилий на -цкий образованы от названий населённых пунктов. Однако «Гонорацкий» вряд ли произошёл от топонима: на картах нет известного села Гонора или Гоноры. Скорее всего, это искусственная фамилия, созданная по модели «шляхетских» фамилий на -ский, которые в Речи Посполитой носили как знак благородного происхождения. Человек, получивший прозвище Гонора (от лат. honor), мог быть назван Гонорацким — «принадлежащий к роду Гоноры» или «происходящий от Гоноры».

Вторая, менее вероятная версия, связывает фамилию с греческим словом «гонора» — «свекровь». Но в таком случае форма «Гонорацкий» означала бы «сын свекрови», что лишено логики и не подтверждается аналогиями. Поэтому основная гипотеза — книжное, семинарское или шляхетское происхождение. В духовных училищах XVIII–XIX веков семинаристам часто давали «благозвучные» фамилии по латинским корням: например, Адоратский (от adorare — «поклоняться»), Амантский (от amare — «любить»). Гонорацкий мог появиться в той же среде — как фамилия, подчёркивающая честность, достоинство или просто красивый звон.

Географически фамилия редкая и встречается в основном на западе бывшей Российской империи: в Беларуси, на Украине и в приграничных с Польшей областях России. В дореволюционных метрических книгах Гонорацкие изредка попадаются среди мещан и духовенства. После революции фамилия почти исчезла — многие носители эмигрировали или сменили фамилии на более простые. Сегодня Гонорацких в России единицы, и для них это скорее всего фамилия-реликвия, напоминающая о латинской образованности предков или о польских корнях рода.