Фамилия Гранниковы (и её мужская форма Гранников) образована по одной из самых распространённых в русском языке моделей: от личного имени или прозвища через суффикс -ник- и родовое окончание -ов. Суффикс -ник- в таких фамилиях обычно указывал на принадлежность к чему-то или на характерный признак человека. В основе здесь лежит имя Гран.

Где искать корни? Первая и наиболее прямая версия — от имени Гран, которое в старину действительно встречалось на Руси. Его связывают с латинским «granum» — «зерно». Имя могло быть как календарным (церковным), так и мирским, данным в честь какого-либо качества или пожелания плодородия. В таком случае Гранников — буквально «сын (или потомок) Грана».

Вторая версия, менее очевидная, но тоже имеющая основания, отсылает к географии. Фамилия могла закрепиться за выходцем из местности с похожим названием. Известно, например, село Гранов на Украине (под Уманью). Если предок переселился оттуда, его могли прозвать Грановским или Гранниковым — то есть «тем, кто из Грани». Со временем прозвище, указывающее на место выхода, превратилось в фамилию.

Обе гипотезы рабочие, но первая (от имени Гран) кажется более естественной для фамилии с суффиксом -ник-: такие фамилии чаще образовывались от имени отца, а не от названия села. Для «географического» варианта типичнее были бы суффиксы -ский/-цкий.

Точное время появления фамилии Гранников установить сложно. Как и большинство русских фамилий, она складывалась постепенно, в XV–XVII веках, когда крестьянские и городские прозвища начали закрепляться за родами. В документах фамилия встречается нечасто, что говорит о её относительной редкости. Встречаются также варианты написания с одной «н» — Граников, что могло быть следствием путаницы или особенностей местного произношения.