Фамилия Гранины (в мужской форме Гранин) образована от имени собственного, и у её происхождения есть несколько версий. Наиболее убедительная из них связывает фамилию с крестильным именем Евграф (в переводе с греческого — «хорошо пишущий»). В обиходе это имя давало множество уменьшительных форм, и одна из них — Граня — стала основой для фамилии. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть человеком по имени Граня, а его потомки получили фамилию по отцу: «чей?» — Гранин.

Менее распространённая версия выводит фамилию из географического названия. На Украине, неподалёку от Умани, есть село Гранов, и выходца оттуда могли прозвать Граня. В таком случае фамилия указывала бы не на личное имя, а на место, откуда человек родом. Третья гипотеза возводит корень к латинскому «granum» — «зерно», но эта версия выглядит натянутой, так как связь с зерном в русской антропонимии встречается редко и обычно через другие словообразовательные модели.

Словообразовательная модель здесь проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность. Такие фамилии в русском языке типичны для крестьянской и мещанской среды, где отчество или прозвище отца переходило в фамилию детей без изменений. Фамилия Гранин — один из многих памятников славянской письменности, сохранивший в себе живую народную форму имени, которая со временем почти вышла из употребления.