Фамилия Гречухина в своей основе содержит прозвище Гречуха. Скорее всего, так называли продавца изделий из гречневой муки — гречневиков, блинов или каши. Род занятий в те времена часто становился семейным прозвищем, которое затем закреплялось за детьми и внуками.

На украинское происхождение фамилии указывает суффикс -ух. В украинской ономастике этот суффикс характерен для прозвищ и фамилий, образованных от названий продуктов, ремесел или особенностей человека: например, Гречуха, Борщуха, Картохуха. В русской традиции такая модель встречается реже, поэтому можно с высокой долей уверенности говорить, что корни фамилии — на территории современной Украины или в южнорусских областях, где украинское влияние было сильным.

Фамилия Гречухина — женская форма, образованная через притяжательный суффикс -ин. Мужской вариант — Гречухин. Окончание -ин указывает на принадлежность: «дочь (или жена) Гречухи». Такая модель типична для восточнославянских фамилий и говорит о том, что фамилия закрепилась в крестьянской или мещанской среде, где отчества и фамилии по отцу были нормой.

Точное время возникновения фамилии установить сложно: процесс формирования фамилий у разных сословий растянулся на несколько столетий. У крестьян и мещан фамилии окончательно закрепились лишь к концу XIX века. Более детально выяснить историю конкретного рода Гречухиных можно только через генеалогические исследования: метрические книги, ревизские сказки и переписи населения.