Фамилия Грекалова — женская форма от Грекалов, и в ней сразу заметна необычная основа. В отличие от множества фамилий на -ов, образованных от крестильных имён или названий профессий, здесь корень «грек-» указывает на национальность. Прозвище Грек или Грекал могли дать человеку, который был родом из Греции, говорил с акцентом или просто имел смуглую внешность, напоминавшую южанина. В русских говорах слово «грек» иногда закреплялось за торговцами, приезжавшими из южных земель, или за выходцами из греческих поселений в Крыму и Причерноморье.

Словообразовательная модель проста: к основе «Грекал-» (где суффикс -ал- характерен для прозвищ, ср. «кричал», «ломал») добавили патронимический суффикс -ов, а затем образовали женскую форму. Фамилия Грекалов встречается в основном в южнорусских и украинских регионах, особенно в бывших землях Войска Донского и в Новороссии, где греческие общины были заметны. В документах XVII–XVIII веков фиксируются греческие купцы и ремесленники, оседавшие в русских городах, и их потомки нередко получали фамилии по этническому признаку.

Споров вокруг происхождения почти нет: версия о греческом корне — единственная серьёзная. Иногда пытаются связать фамилию с диалектным глаголом «грекать» (греметь, стучать), но это натяжка: в русской ономастике прозвища от звукоподражаний редки, а для фамилии Грекалов нет убедительных примеров такой этимологии. Таким образом, предки носителей фамилии с высокой вероятностью были либо греками по происхождению, либо русскими, получившими прозвище за связь с греческой средой — например, за службу в греческих отрядах или торговлю с греками.