Фамилия Грибунина хранит в основе неочевидное слово, которое почти вышло из живого обихода. Если отбросить типичный для женского варианта суффикс -ин, останется мужская форма Грибунин. А в её корне — «грибуна». В русских говорах, особенно на севере и в Сибири, так называли неопрятного, неряшливого человека, того, кто ходит в грязной, измятой или рваной одежде. Слово образовано от «гриба» — складка, сборка, морщина на ткани, и буквально описывало человека, чья одежда «сборилась», висела мешком. Прозвище Грибуна, таким образом, давали не за внешность или характер, а за манеру одеваться или за бедность, которая не позволяла следить за костюмом.

Модель образования типична для русских фамилий: прозвище на -а (Грибуна) плюс притяжательный суффикс -ин, означающий «чей?» — сын Грибуны, потомок Грибуны. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и это нормально: большинство русских фамилий с суффиксом -ин как раз из простонародной среды. Интересно, что в отличие от более частых фамилий от прозвищ по поведению (Воробьёв, Шумилин), Грибунин отсылает к бытовой, вещной характеристике — не к тому, как человек поступает, а к тому, как он выглядит со стороны.

Встречается фамилия прежде всего на Русском Севере и в Вятском крае, где говор сохранил слово «грибуна» в активном употреблении. В современных телефонных справочниках и базах данных носители Грибуниных рассеяны по всей России, но заметная часть по-прежнему живёт в Кировской и Архангельской областях. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Грибу́нина, хотя в отдельных семьях могли закрепить и на третий — Грибуни́на, по аналогии с фамилиями на -инин.

Поскольку прозвище не связано с именем или профессией, а описывает внешний признак, фамилия Грибунина — яркий пример того, как русский человек получал фамилию по случайной, но запоминающейся черте. Предок носителя этой фамилии, скорее всего, был крестьянином, которого в деревне дразнили за небрежный вид. Со временем прозвище закрепилось за его детьми и внуками, утратив изначальную насмешку и став нейтральным родовым именем.