Фамилия Грубенков образована от прозвища или нецерковного имени Грубенок. Основа здесь — прилагательное «грубый» в его старом, более широком значении: не только «невежливый», но и «неотёсанный», «простой», «суровый» или даже «крупный, толстый» (в говорах «грубый» могло означать «большой, массивный»). Суффикс -енок (-ёнок) в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин, и обычно указывает на «младшего»: в прямом смысле — сына, либо в переносном — человека, носящего прозвище на -енок. То есть Грубенков буквально означает «сын Грубенка», а Грубенок — это либо «маленький грубый» (ласкательно-уменьшительное прозвище), либо, что вероятнее, прозвище взрослого человека, образованное по той же модели, что и Козлёнок, Волчонок, Жеребёнок.

Вторая, менее очевидная версия отсылает к диалектному слову «грубень» — так в некоторых областях называли крупный песок или щебень. Если прозвище Грубенок дали человеку, работавшему с таким материалом (каменщику, мостовщику), фамилия могла бы стать профессиональной. Однако эта гипотеза слабее: слово «грубень» не было широко распространено, а модель прозвищ от названий сыпучих материалов через суффикс -енок нетипична для русской ономастики.

Географически фамилия Грубенков тяготеет к центральным и южным областям России, встречается в Воронежской, Тамбовской, Ростовской областях. Форма на -ов, а не на -ин, говорит о том, что основа (Грубенок) воспринималась как существительное мужского рода, а не как прилагательное. По сословному происхождению Грубенковы, скорее всего, были крестьянами или мещанами: фамилии на -енок редко встречались в дворянской среде, где преобладали модели на -ов/-ев.

В написании фамилии возможна путаница с похожей, но самостоятельной фамилией Грубеньков (от прозвища Грубенька). Разница в суффиксе: -енк- против -еньк-. В говорах оба варианта могли сосуществовать, и при переписях их нередко смешивали. Если в вашем роду есть документы XIX века, стоит проверить, как именно записана фамилия — с «е» или с «ё» (Грубёнков), так как «ё» могло заменяться на «е» при записи, и это меняет ударение.