По одной из них, эта фамилия восходит к имени Груша – производному варианту мужского имени Агриппа (в переводе с латинского языка – «горестный») или женского Агриппина. Согласно другой, менее правдоподобной гипотезе, фамилия Грушенков образована от нецерковного имени Груша, которое восходит к аналогичному названию дерева. Со временем, вероятно, род Грушенко переехал в Россию, где и произошла русификация фамилии путем добавления суффикса -ов.