Фамилия Грушенко образована по одной из самых распространённых в восточнославянском именослове моделей: от основы через суффикс -енко. Этот суффикс, характерный прежде всего для украинской ономастики, означал «сын» или «потомок», поэтому Грушенко — буквально «сын Груши». Исходное личное имя или прозвище Груша и стало тем корнем, от которого пошла фамилия.

Вопрос в том, что именно стояло за этим именованием. Самая прямая версия — мирское имя Груша. До введения обязательных христианских имён на Руси было принято давать ребёнку «растительное» имя, чтобы природа приняла его как своего. Считалось, что вместе с именем к человеку переходят свойства растения: сила, плодовитость, здоровье. Груша в этом ряду — одно из понятных и тёплых имён. Есть и любопытный фольклорный оттенок: в некоторых регионах груша почиталась как дерево, под которым можно было молиться, что сближало её с сакральными символами.

Однако у фамилии Грушенко есть и вторая, вполне бытовая версия. Грушей могли прозвать не по имени, а по занятию — садовода, торговавшего плодами, или того, кто варил грушевое варенье и компоты. В этом случае фамилия относится к разряду «профессиональных» прозвищ, которые закреплялись за целым родом. Выращивание груш в Малороссии и южных губерниях было делом привычным, так что географически фамилия Грушенко чаще всего встречается именно в украинских и южнорусских областях.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Грушин, Грушевский, Грушко) показывает разницу в словообразовании. Если Грушин — это чисто русская форма с суффиксом принадлежности -ин, то Грушенко — типично украинская патронимическая модель. Грушевский, в свою очередь, указывает на связь с местностью («из Грушева»). Таким образом, по одной только фамилии Грушенко можно с большой вероятностью предположить, что её носитель происходит из семейства, жившего на территории современной Украины или прилегающих к ней земель, а его предок носил либо личное имя Груша, либо занимался садоводством.