Фамилия Груненко — одна из тех, что хранят в себе сразу несколько возможных историй. Её основа — прозвище Грунь, а суффикс «-енко» прямо указывает на украинское происхождение. В украинской ономастике этот суффикс традиционно означал «сын» или «потомок», так что Груненко — буквально «сын Груня». Фамилия распространена в основном на востоке Украины и в прилегающих областях России.

Прозвище Грунь могло возникнуть из разных источников. Первый — от нарицательного «грунь», которым в старину называли один из конских аллюров, тихую рысь. В народе говорили: «Грунью от смерти не уйдешь», «Грунью поля (века) не избегаешь». Такое прозвище могли дать человеку суетливому, вечно спешащему, который пытался всё успеть, но без особого успеха.

Вторая версия — топонимическая. В Полтавской губернии, в Зеньковском уезде, есть местечко Грунь. Выходец из этого села или, наоборот, человек, который там поселился, мог получить прозвище Грунь. Для крестьян, которые редко покидали родные места, привязка к названию села была естественным способом идентификации.

По сословному составу фамилия Груненко, скорее всего, принадлежала крестьянской или казацкой среде. Украинские фамилии на «-енко» в XVII–XVIII веках активно формировались именно среди этих слоёв, в отличие от дворянских, где преобладали модели на «-ов», «-ский» или польские окончания.

Встречаются и однокоренные фамилии: Грунь, Грунский, Грунёв. Но Груненко — самая распространённая из них, что говорит о её укоренённости в народной среде. Интересно, что ударение в фамилии обычно падает на второй слог: Груне́нко, хотя в некоторых регионах можно услышать и Гру́ненко.