Фамилия Губатюк — яркий пример украинской модели фамильного суффикса -юк, который в западных и центральных регионах Украины выполнял ту же роль, что русский -ов или белорусский -ович: указывал на сына или потомка человека. Если разобрать фамилию по составу, основа Губат- плюс суффикс -юк дают значение «сын Губатого» или «потомок того, кого прозвали Губатый». В отличие от более частых в России фамилий на -ов, Губатюк сохраняет типично украинское окончание, которое в документах Российской империи часто русифицировали, но здесь оно осталось в исходной форме.

Прозвище Губатый, от которого пошла фамилия, не стоит понимать буквально как обладателя больших губ. В народной речи «губатый» могло означать человека с выразительными, чувствительными губами, но чаще так дразнили того, кто любил поговорить, похвастаться или, наоборот, был обидчивым и «надувал губы». В некоторых говорах «губатый» — синоним «нахрапистого», нагловатого человека. Таким образом, предок Губатюков мог быть либо словоохотливым, либо вспыльчивым — прозвище давали по заметной черте характера, а не по внешности.

Географически фамилия Губатюк тяготеет к западу Украины: чаще всего встречается в Хмельницкой, Ровенской, Житомирской областях, а также в соседних районах Беларуси. Это зона распространения суффикса -юк, который в Полесье и на Волыни особенно активен. В России Губатюки редки и, как правило, ведут родословную от переселенцев из украинских губерний.

Стоит отметить, что у фамилии есть «двойники» с тем же корнем, но другими суффиксами: Губатый, Губатенко, Губатов. Губатюк стоит в этом ряду особняком — он не просто указывает на признак, а прямо называет потомка человека с таким прозвищем, что характерно для украинской антропонимии XIX века, когда фамилии окончательно закреплялись за крестьянскими родами.