Фамилия Губернатор — редкий случай, когда прозвище или должность перешли в фамилию без всяких суффиксов, в чистом виде. В русской традиции такие «голые» фамилии встречаются нечасто и обычно указывают на позднее происхождение или нерусские корни. В данном случае перед нами, скорее всего, не официальный титул, а прозвище. Губернатором в народе могли прозвать человека властного, важного, любящего командовать, либо того, кто работал при губернаторе — например, слугу, приказчика или управляющего имением. В крестьянской среде такое прозвище часто давали с иронией: если мужик в деревне вёл себя как начальник, его так и называли.

Слово «губернатор» пришло в русский язык из польского (gubernator) или немецкого (Gouverneur), а те, в свою очередь, взяли его из латыни (gubernator — «кормчий, правитель»). В России должность губернатора появилась при Петре I в 1708 году, но фамилия могла возникнуть и позже, в XVIII–XIX веках, когда прозвище закрепилось за родом. Написание фамилии устойчивое, без вариантов вроде «Губернаторов» — это подчёркивает её нестандартность.

Географически фамилия Губернатор встречается редко, преимущественно на юге России, в казачьих областях, а также среди еврейского населения бывшей черты оседлости. У евреев фамилии по должностям и титулам давали искусственно в XIX веке, при обязательной паспортизации, так что Губернатор мог появиться и как «красивая» фамилия, без прямой связи с реальной должностью. В любом случае, носитель этой фамилии может с уверенностью сказать, что его предок выделялся характером или положением — либо вызывал у окружающих уважение, либо насмешку.