Фамилия Губернатенко — яркий пример украинской фамилии, образованной по продуктивной модели на -енко. В украинской ономастике суффикс -енко, изначально уменьшительный, к XVII–XVIII векам превратился в главный патронимический показатель, означающий «сын» или «потомок». Таким образом, Губернатенко — это «сын Губерната» или, шире, «потомок человека по прозвищу Губернат».

Основа фамилии — прозвище Губернат. Оно напрямую восходит к слову «губернатор» (от лат. gubernator — кормчий, правитель). В украинском языке это слово могло звучать как «губернатор» или в усечённой форме «губернат». Прозвище давали не только реальным чиновникам. В народной среде так могли называть человека властного, важного, склонного командовать, либо того, кто служил при губернаторе или выполнял его поручения. Возможно ироничное происхождение: «губернатором» в шутку дразнили местного богатея, старосту или просто задиру.

В отличие от русских фамилий на -ов/-ев, которые указывали на принадлежность отцу (Иван Петров — сын Петра), украинские фамилии на -енко фиксировали родство более прямо и рано стали наследственными. Фамилия Губернатенко закрепилась преимущественно на Левобережной Украине, в исторических Полтавской, Черниговской и Харьковской губерниях. Встречаются и варианты написания: Губернаторенко, Губернатов, Губернатенков — последний результат обрусения фамилии при переселении носителей в великорусские губернии.

Социальный состав носителей фамилии был пёстрым. Поскольку прозвище не указывало на ремесло, а на характер или должность, Губернатенко могли быть и казаками, и крестьянами, и мещанами. В ревизских сказках XIX века эта фамилия встречается у государственных крестьян и казаков Слобожанщины. Дворянского происхождения у неё нет — это типичная народная фамилия, возникшая из бытового прозвища.

Редкость фамилии объясняется тем, что основа «губернатор» в прозвищах использовалась реже, чем, скажем, «воевода» или «атаман». Тем не менее, в украинских метрических книгах XVIII–XIX веков Губернатенко фиксируется стабильно, что говорит о давней укоренённости рода в определённых сёлах. Если ваши предки носили эту фамилию, стоит искать их в архивах Полтавской или Харьковской губернии — вероятнее всего, они были потомственными жителями одного из хуторов или слобод.