Фамилия Гуген — одна из тех, где с ходу не угадаешь ни происхождение, ни суффикс. На слух она кажется иноязычной, и это первое, что бросается в глаза. В русской ономастике фамилии на -ен встречаются нечасто, но они есть — и почти всегда указывают на западнославянское или немецкое влияние.

Скорее всего, перед нами фамилия немецкого или еврейского (ашкеназского) происхождения. В немецком языке Gugen — это вариант фамилии Guggen, которая восходит к средневерхненемецкому gucken — «смотреть, выглядывать». В таком случае прозвище могли дать наблюдательному человеку, зеваке или тому, кто работал дозорным. Вторая версия — топонимическая: Гуген мог получить человек, переехавший из местечка с похожим названием (например, Гугген в Швейцарии или Германии). В русском написании фамилия закрепилась без удвоенной согласной, что типично для адаптации немецких фамилий в XIX веке.

Если же фамилия исконно русская, то её основа — нестандартная. Суффикс -ен в восточнославянских фамилиях редок и обычно указывает на украинское или белорусское происхождение (сравните: Ковален, Бондарен). Но корень «гуг» в славянских языках не образует очевидных прозвищ. Возможно, это диалектное слово — например, в псковских говорах «гуга» означала «шишка, нарост», а в южных — «глухой звук». Тогда Гуген — потомок человека с заметной внешней особенностью или с глуховатым голосом. Однако эта версия менее вероятна: носителей фамилии Гуген в России немного, и большинство из них сосредоточено в регионах бывших немецких колоний (Поволжье, юг Украины).

География фамилии подтверждает немецкий след. По данным переписей XIX — начала XX века, Гугены встречались среди колонистов Саратовской губернии и в Одесском уезде. В советское время часть носителей русифицировала написание на Гугин или Гугенов, но исходная форма сохранилась. В современной России фамилия редкая — по разным оценкам, её носят не более нескольких сотен человек.

Что касается социального статуса предков: если они были немецкими колонистами, то скорее всего — крестьянами или ремесленниками (плотниками, мельниками). Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В еврейской среде Гуген могла быть искусственной фамилией, данной при переписи населения в Австро-Венгрии или Пруссии — от того же gucken в значении «соглядатай».

Итог: фамилия Гуген — почти наверняка немецкая по корню, с прозвищной или топонимической основой. В России она прижилась как следствие переселенческой политики XVIII–XIX веков и сохранила оригинальное звучание, не растворившись в типовых суффиксах.