Фамилия Гугнина — одна из тех, что хранит живую черту далекого предка, причем черту вполне конкретную. В её основе лежит прозвище Гугня, которое в русских говорах означало «гнусавое бормотанье», невнятную речь вполголоса. Так могли назвать человека, который говорил себе под нос, негромко и неразборчиво, или же имел природный дефект речи — гнусавость.

Модель образования фамилии проста и прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность, родство. Гугнина — это «дочь» или «жена» Гугни. В русской традиции фамилии на -ин чаще всего образовывались от основ на -а/-я, что полностью совпадает с прозвищем Гугня.

Примечательно, что прозвище Гугня не было выдумкой или случайным словом. В истории оно закрепилось за легендарным персонажем — первым атаманом яицких (уральских) казаков Василием Гугней. Этот факт не делает всех носителей фамилии прямыми потомками атамана, но показывает, что прозвище бытовало в вольных казачьих общинах, а значит, корни фамилии могут уходить в XVI–XVII века, в среду служилых людей южных и восточных рубежей России. Вероятно, предок-носитель такого прозвища обладал схожей манерой речи и жил именно в тех краях, где казачья вольница была обычным делом.

Словообразовательный разбор не оставляет простора для альтернативных версий: основа Гугн- и суффикс принадлежности -ин — классическая русская модель. Фамилия редкая, что только подчеркивает её связь с конкретным прозвищем, а не с массовым крестильным именем. Таким образом, Гугнина — это фамилия-характеристика, прямо указывающая на речевую особенность далёкого родоначальника.