Фамилия Гугнин образована от личного прозвища и относится к распространенному типу русских фамилий. Фамилия Гугнин образована от прозвища Гугня, которое, скорее всего, восходит к аналогичному нарицательному со значением «гнусавое бормотанье». Очевидно, это прозвище указывает на особенности речи предка: он, вероятно, имел обыкновение постоянно что-то говорить вполголоса. Прозвище Гугня носил легендарный первый атаман яицких (уральских ) казаков Василий Гугня. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Гугня, со временем получил фамилию Гугнин. О точном месте и времени возникновения фамилии Гугнин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Гугнин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.